表观遗传调控是指通过改变基因表达而不改变DNA序列的方式来调节细胞功能和发育。在肿瘤发生和发展的过程中，表观遗传调控扮演着重要的角色。因此，建立一个全面的、跨肿瘤类型的表观遗传调控图谱对于深入研究肿瘤发生和发展机制具有重要意义。为了打开市场，眼科基因治疗不断的提升业务发展的能力，为其塑造卓尔不凡的品牌形象。澎立生物专注于提供包括生物标志物检测,抗病毒药物筛选,疾病动物模型等符合国际标准的药物发现,早期筛选,体内外药效,药物代谢及动力学,non-GLP毒理,美国GLP标准的毒理,三类医疗器械评价研究服务!https://www.pharmalegacy.com.cn/

2023年11月1日，来自美国圣路易斯华盛顿大学的LiDing团队和普林斯顿大学的BenjaminJRaphael团队等在Nature杂志上合作发表了文章Epigeneticregulationduringcancertransitionsacross11tumourtypes。

研究介绍

研究团队使用单细胞和单核RNA测序技术，对225个样本的单核染色质可及性数据进行了分析，构建了一个全癌种的表观遗传和转录组图谱。通过检测来自结肠癌、胰腺导管腺癌（PDAC）、皮肤黑色素瘤、子宫内膜癌、卵巢癌和乳腺肿瘤等癌症的100多万个细胞的可及性区域、转录因子基序和调控元件，研究团队鉴定了与癌症转化相关的表观遗传驱动因子。

研究发现，一些表观遗传驱动因子在多种癌症中都存在，而另一些则是特定于某种癌症。此外，研究还发现，增强子可及性与基因表达之间存在显著的相关性，并揭示了表观遗传和遗传驱动因子之间的合作。这个图谱为进一步研究癌症转化中的表观遗传动态提供了基础，确定了与癌症相关表观遗传驱动因素，并强调了转录因子作为预后标志物的潜力。

11种肿瘤类型的染色质可及性模式

该研究对药物研发的重要性

在药物开发方面，该图谱为癌症治疗提供了潜在的治疗靶点。识别与癌症转移相关的表观遗传驱动因素，以及与癌症起始和转移相关的途径，可以帮助研究人员开发针对这些特定途径的新药。此外，通过关注广泛的转录程序来识别潜在的靶向元件可以帮助研究人员开发针对这些元件的药物。总的来说，该图谱为癌症的分子机制提供了有价值的见解，并有助于开发新的癌症治疗方法。

研究中采用的动物验

在整个研究的验过程中，研究者们采用了多种模型，包括小鼠模型，作者使用KrasG12D突变和Trp53缺失驱动的胰腺导管腺癌(PDAC)基因工程小鼠模型对小鼠PDAC进行多重免疫组化(mpIHC)分析。他们将包埋组织切成6μm的薄片，并将其装入BONDRXm(徕卡生物系统)中进行一系列染色，包括使用针对GATA6和CK19的抗体。作者使用这些小鼠模型来研究参与转移的转录程序，并确定重要的预后标志物。小鼠模型在研究中发挥了重要作用，为研究驱动癌症进化的分子基础提供了一个平台。

通过这一研究，研究团队从11种癌症的225个样本中创建并研究了肿瘤和nat的大规模单细胞多组学图谱，揭示了不同的癌症和正常组织细胞类型，为癌症生物学提供了细致的见解，包括癌症特异性表观遗传结构、正常和恶性细胞之间的关系，以及同一谱系中的原发性向转移性转变。

研究团队根据与癌细胞共享的染色质可及性模式确定了比较接近肿瘤细胞的正常细胞类型，强调了表观遗传结构在确定细胞起源中的重要性，并为从正常细胞到癌症的转变提供了重要见解。在同一类型的原发性和转移性癌症之间，研究发现了染色质可及性的变化，并对不同类型的肿瘤进行了比较，这凸显了不同类型癌症在染色质图谱和控制癌症进展的表观遗传程序方面的共性和差异。

通过了解不同肿瘤的染色质结构、癌症关键转变时染色质可及性的变化，以及染色质可及性、遗传改变和转录模式之间的相互作用，对于推进癌症生物学和临床践至关重要。染色质可及性的某些变化代表了癌症起始和转移扩散的关键事件驱动因素，可能是潜在的治疗靶点。虽然传统疗法很难靶向转录因子，而且转录因子在正常组织中的多种作用引起了人们对脱靶效应的担忧，但我们通过关注广泛的转录程序，突出了潜在的可靶向元件。比较后，我们预计该图谱将成为未来癌症研究的宝贵资源。